可在糖化过程蛋白质休止期或后发酵中添加。通常为25~75 g/吨麦汁或发酵液汁。最佳用量应通过实验决定。

木聚糖是木纤维和非木纤维的主要组成成分。在纸浆蒸煮过程中，木聚糖部分溶解、变性并重新沉积在纤维表面上。此过程中若使用木聚糖酶，就可以清除部分再沉积下来的木聚糖。这样增大了纸浆基质孔隙，使被困的可溶性木质素释放出来，同时也使得化学漂白剂能更有效地渗透进入到纸浆中。总的说来，它可提高纸浆的漂白率，并因此减少化学漂白剂的用量。潍坊宇瑞贸易有限公司经营的木聚糖酶是降解木聚糖的专一性酶，它只降解木聚糖而不能使纤维素分解。木聚糖酶由不同微生物共同作用而形成，在一定pH和温度范围内使用可获得效果。AU-PE89利用造纸工业专用细菌菌种开发得到，它特别适用于牛皮纸浆的高温和碱性pH环境。