明胶胶囊虽有很多优点，但也存在不足：1）由于醛基、亚胺或酮类等基团的存在，胶囊在储存过程中易发生交联，形成稳定的明胶网络，减缓胶囊的溶出，降低其生物利用度；2）明胶来源于动物的皮或骨，因此素食主义者用药时不方便；3）明胶胶囊囊壳材料来源于动物皮或骨，易传播海绵组织脑科——疯牛病；4）软胶囊囊壳机械特性易受温度和水分影响——囊壳中增塑剂的加入，增加了氧渗透率和水分在囊壳和胶囊内容物间的转移，极少量的水分变化就会对药物的溶出造成很大影响；5）软胶囊还存在药物迁移的现象。因此，需要寻找改性明胶或明胶替代品来改善明胶胶囊的缺陷。