由于构成多糖的单糖类型、聚合度、糖键连接及排列方式、糖基上羟基的取代情况等各异，导致不同的多糖在溶解度、粘度等性质上存在着明显的差别，这极大影响了β一甘露聚糖酶的水解。试验表明：难溶性的甘露多糖一般较可溶性的甘露多糖难水解；糖成分复杂的一般较成分简单的难水解；糖基上羟基被取代的一般较未取代的难水解；多分支侧链的甘露多糖一般较线状的水解慢；聚合度低的一般较聚合度高的水解慢。