吴茱萸生长于平地至海拔1500米山地疏林或灌木丛中，多见于向阳坡地。   吴茱萸喜阳光充足、温暖的气候环境。虽然也较为耐寒，但冬季严寒多风且干燥的地区则生长不良。在阴湿地带病害多，结果少，亦不宜生长。 

吴茱萸对土壤要求不严，除过于粘重而干燥的黄泥外，中性、微碱性或微酸性的土壤都能种植生长，尤以土层深厚、疏松肥沃、排水良好的壤土或砂质壤土为好。不耐涝、低洼积水的土地不宜生长。

育苗繁殖地宜选土质肥沃、疏松、排水良好的土地，深翻曝晒几天后，再碎土耙平，做成宽1-1.3米的畦，畦面按15厘米的行距开沟，作苗床用。